MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Cryptocercus punctulatus) str. Cpu plasmid pCpu

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016598	CAT	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290639
2	NC_016598	AGC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374290639
3	NC_016598	ATT	3	9	689	697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290639
4	NC_016598	GAAA	2	8	707	714	75 %	0 %	25 %	0 %	374290639
5	NC_016598	GAG	2	6	846	851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374290639
6	NC_016598	ATA	2	6	923	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290639
7	NC_016598	A	6	6	964	969	100 %	0 %	0 %	0 %	374290639
8	NC_016598	AAAT	2	8	971	978	75 %	25 %	0 %	0 %	374290639
9	NC_016598	T	8	8	1472	1479	0 %	100 %	0 %	0 %	374290640
10	NC_016598	TA	3	6	1491	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	374290640
11	NC_016598	AACA	2	8	1520	1527	75 %	0 %	0 %	25 %	374290640
12	NC_016598	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	374290640
13	NC_016598	TAT	2	6	1560	1565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290640
14	NC_016598	ATTT	2	8	1586	1593	25 %	75 %	0 %	0 %	374290640
15	NC_016598	T	7	7	1632	1638	0 %	100 %	0 %	0 %	374290640
16	NC_016598	AT	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	374290640
17	NC_016598	TCA	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290640
18	NC_016598	TTC	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290640
19	NC_016598	A	6	6	1742	1747	100 %	0 %	0 %	0 %	374290640
20	NC_016598	AAT	2	6	1769	1774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290640
21	NC_016598	GTT	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374290640
22	NC_016598	TA	3	6	1847	1852	50 %	50 %	0 %	0 %	374290640
23	NC_016598	ATC	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
24	NC_016598	TCTT	2	8	1917	1924	0 %	75 %	0 %	25 %	374290641
25	NC_016598	T	9	9	1948	1956	0 %	100 %	0 %	0 %	374290641
26	NC_016598	T	6	6	1966	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	374290641
27	NC_016598	ATC	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
28	NC_016598	CAAAA	2	10	1979	1988	80 %	0 %	0 %	20 %	374290641
29	NC_016598	A	7	7	2042	2048	100 %	0 %	0 %	0 %	374290641
30	NC_016598	TA	3	6	2075	2080	50 %	50 %	0 %	0 %	374290641
31	NC_016598	TTTAA	2	10	2145	2154	40 %	60 %	0 %	0 %	374290641
32	NC_016598	TTC	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290641
33	NC_016598	TC	3	6	2190	2195	0 %	50 %	0 %	50 %	374290641
34	NC_016598	AATAAA	2	12	2234	2245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374290641
35	NC_016598	T	6	6	2250	2255	0 %	100 %	0 %	0 %	374290641
36	NC_016598	TCCAT	2	10	2265	2274	20 %	40 %	0 %	40 %	374290641
37	NC_016598	AATA	2	8	2275	2282	75 %	25 %	0 %	0 %	374290641
38	NC_016598	T	6	6	2298	2303	0 %	100 %	0 %	0 %	374290641
39	NC_016598	CAT	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
40	NC_016598	TTC	2	6	2315	2320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290641
41	NC_016598	A	6	6	2380	2385	100 %	0 %	0 %	0 %	374290641
42	NC_016598	TTG	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374290641
43	NC_016598	AAT	2	6	2433	2438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290641
44	NC_016598	AGA	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374290641
45	NC_016598	CTG	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374290641
46	NC_016598	CAG	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374290641
47	NC_016598	TAT	2	6	2515	2520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290641
48	NC_016598	TCT	2	6	2583	2588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290641
49	NC_016598	A	6	6	2589	2594	100 %	0 %	0 %	0 %	374290641
50	NC_016598	AATAAG	2	12	2629	2640	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374290641
51	NC_016598	CAT	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
52	NC_016598	AAT	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290641
53	NC_016598	AT	3	6	2773	2778	50 %	50 %	0 %	0 %	374290641
54	NC_016598	TTG	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374290641

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.